До розуміння цілісності людини можна наблизитися за допомогою системного підходу. Система являє собою сукупність елементів і зв'язків між ними, функціонуючих як єдине ціле і що мають єдину мету функціонування.

Людина - це система з пірамідальним принципом побудови (так звана піраміда Maslow). Услід за древніми греками в ній виділяють три рівні - нижчий, тілесний (від греч. soma - тіло), середній, психічний (греч. psyche - душа), і вершину - духовний елемент (греч. nous - дух).

Піраміда має свої закони організації. Організація ця иерархична і що визначає, задаючим режим діяльності всієї системи елементом є вершина. Взаємовідносини між елементами всередині піраміди підлеглі законам гармонії, ці особливості системи забезпечують її динамічну стійкість і можливість розвитку.

Людина є частиною світу, він включений в нього як одна з підсистем. У свою чергу всередині себе, в своїй біологічній структурі людина має так звані мини-системи подібності, в яких відображений весь організм. Це райдужна оболонка ока, вушна раковина, шкіра долонь і ступень і т. д. По змінах в цих структурах можна провести діагностику стану здоров'я, а, впливаючи на них, - коректувати відхилення. Елементарною мини-системою подібності організму є кожна його клітка.

Кожний з трьох рівнів системи "чоловік" розглядається як підсистема, організована за тим же принципом, що і ціла система. У цих підсистемах першого порядку, в свою чергу, виділяють підсистеми другого порядку і т. д. Підсистеми всіх порядків функціонують у відносно автономних режимах, але при дотриманні принципів взаємозв'язку і підкорення нижчого рівня вищому. Принцип взаємозв'язку виявляється як у взаємних впливах різних підсистем, так і в наявності у них загальних блоків, тобто у взаимоперекрещиванії. Тому одна підсистема неминуче залучає до роботи іншої і людина реагує на впливи як єдине ціле. Дослідження людини як єдиного цілого складає принцип холизма (від лати. holos - цілісний).

Як відомо, системообразующим чинником є кінцевий результат, мета функціонування системи. Структура системи визначається метою, і зміна мети вимагає зміни структури. Порушення в структурі, природно знижують імовірність досягнення мети. Виділяють чотири базові цілі життя людини. На соматичному рівні їх дві: виживання, тобто формування і збереження своєї індивідуальної біологічної структури, і репродукція, що забезпечує інтереси вигляду, збереження популяції. На психічному рівні людина прагне реалізувати себе як особистість, тобто прожити повноцінне життя в суспільстві. У вищій сфері людина здійснює внутрішній шлях психічної трансформації, розвиваючи альтруїзм, намагаючись зрозуміти своє місце в світі, пройти життя в згоді зі своїми індивідуальними схильностями, тобто відбутися як духовна індивідуальність. Перевага може віддаватися різним цілям в залежності від рівня розвитку індивіда і обставин його життя.

Згідно з структурою цілей життя людини визначаються окремі аспекти валеології як науки: 1) індивідуальне фізичне здоров'я (діагностика, прогнозування, формування, збереження і зміцнення) і адаптація, проецирующиеся на стратегію виживання; 2) репродуктивное здоров'я у всьому різноманітті цієї проблеми; 3) психічне здоров'я і управління ним; 4) роль свідомості в збереженні здоров'я.

За допомогою системного підходу найбільш глибоко проаналізований біологічний рівень людини. Як ціле биосистема володіє такими інтегральними якостями, якими не володіють її окремі елементи. Ці елементи (живі системи меншого масштабу - системи, органи, тканини, клітки) поза зв'язком не можуть підтримувати індивідуальне існування. З метою координації цілої системи організму свобода окремих його елементів обмежена через їх взаємодію, взаємообумовленість в цілому ансамблі. Ця взаємодія передбачає, з одного боку, принцип економії структур, а з іншою - багаторазову підстраховування функцій, тобто в кожному елементі є безліч субелементов, які можуть використовуватися іншими елементами. Інтегруючим елементом, вершиною пірамідальної системи біологічного рівня є нейрогормонально-імунний ансамбль.